洁净室按用途分类可分为两大类：
①工业洁净室：
以无生命微粒的控制为对象。主要控制空气尘埃微粒对工作对象的污染，空气净化工程施工，内部一般保持正压状态。它适用于精密机械工业、电子工业(半导体、集成电路等)宇航工业、高纯度化学工业、原子能工业、光磁产品工业(光盘、胶片、磁带生产)、LCD (液晶玻璃)、电脑硬盘、电脑磁头生产等多行业。
②生物洁净室：
以控制有生命微粒(细菌)与无生命微粒(尘埃)对工作对象的污染。又可分为：
A.一般生物洁净室：
主要控制微生物(细菌)对象的污染。同时其内部材料要能经受各种灭菌剂侵蚀，内部一般保持正压。实质上就是其内部材料要能经受各种灭菌处理的工业洁净室。例：制药工业、医院(手术室、无菌病房)食品、化妆品、饮料产品生产、动物实验室、理化检验实验室、血站等。
B.生物学安全洁净室：
主要控制工作对象的有生命微粒对外界和人的污染。内部要保持与大气的负压。例：细菌学、生物学洁净实验室、生物工程
扫描间内必须采用非磁性、屏蔽电磁波的风口，不允许任何建筑设施管道穿越。
G、振机的液氦冷却系统必须设置单独的排气系统，山东空气净化，直接连接到核机的室外排风管。管道必须采用非磁性材料，管径不小于250mm。
H、核医学科（ECT）宜采用独立的恒温恒湿空调系统，扫描间温度宜取22±2℃，相对湿度60%±10％。且1小时内的温度变化不大于3℃。
I、其他房间可采用一般空调，但排风应按《临床核医学卫生防护标准》(GBZ120)和《医用放射性废弃物管理卫生防护标准》(GBZ133)处理。
J、 放射科空调系统必须根据放射性同位素种类与使用条件确定。宜采用单风管的全新风空调方式。
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