多重循环风空调箱通过送风管，再经过ULPA过滤器或HEPA过滤器，将空气送入洁净室，在洁净度等级为10级和1级的洁净间的吊顶上，这些过滤器通常是100%覆盖。垂直单向气流向下通过洁净间，穿过带孔的架空地板砖进入地板下面的回风空间，洁净室等级，再通过垂直回风夹道向上进入吊顶回风静压箱。然后 ，空气再次进入循环风空调箱，威海洁净室，以上的空气循环再次重复。如果是使用吊顶风机过滤器，洁净室净化工程设备，在风机过滤器上面的吊顶空间时，可以安装水或直接交换冷却[DX-cooled]风机盘管实现表面冷却。
手术部的空调系统设置
1、洁净手术部的设计与均应遵循《医院洁净手术部建筑技术技术规范》的规定。
2、一般手术室应采用末端过滤器不低于高中效过滤器的空调系统或全新风系统。室内保持正压，换气次数不得低于6次/时。
医技科室的空调系统设置
1、 检验科、病理科应满足以下要求：
A/应有单独排风系统，产生有害气体的部位（试剂配置、标本处理、实验装置等）应采用负压洁净工作台，涉及对人体或环境有危害的微生物气溶胶操作，应在二级（含）以上生物安全实验室中进行。
B、若采用一般空调系统，温度为22~26℃，相对湿度30%~60%。
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