洁净室按用途分类可分为两大类：
①工业洁净室：
以无生命微粒的控制为对象。主要控制空气尘埃微粒对工作对象的污染，内部一般保持正压状态。它适用于精密机械工业、电子工业(半导体、集成电路等)宇航工业、高纯度化学工业、原子能工业、光磁产品工业(光盘、胶片、磁带生产)、LCD (液晶玻璃)、电脑硬盘、电脑磁头生产等多行业。
②生物洁净室：
以控制有生命微粒(细菌)与无生命微粒(尘埃)对工作对象的污染。又可分为：
A.一般生物洁净室：
主要控制微生物(细菌)对象的污染。同时其内部材料要能经受各种灭菌剂侵蚀，内部一般保持正压。实质上就是其内部材料要能经受各种灭菌处理的工业洁净室。例：制药工业、医院(手术室、无菌病房)食品、化妆品、饮料产品生产、动物实验室、理化检验实验室、血站等。
B.生物学安全洁净室：
主要控制工作对象的有生命微粒对外界和人的污染。内部要保持与大气的负压。例：细菌学、生物学洁净实验室、生物工程
应保证各室的必要的送排风量。根据放射物质所规定的室内外浓度计算送排风量，室内外浓度应控制在上限定值以下。
L、新风空调机内应设置粗效和中效以上两级空气过滤器。如当排气超过排放浓度上限定值时，洁净室，应在排气侧使用效过滤器。
M、放射性同位素管理区域内，相对于管理区域外要经常保持负压，排气风管的材料宜采用衬里风管。并在排风系统中设置气密性阀门。应在净化处理装置的排气侧设置风机，日照洁净室，保持排风管内负压，排风机后于空调系统关闭。
N、当贮藏室、废物保管室贮藏放射性同位素时，要求24小时排换气。
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