不同清洁区采用不同的水沟，一般清洁区和准清洁区采用明沟上面加不锈钢侧栏盖。高清洁区可以做暗沟，十万级车间净化，（由于暗沟难清洗，日照车间净化，建议采用直接排水管+洁净地漏）因为暗沟难清洗，无尘车间 净化，仅消毒是效果欠佳的；用浅浅的明沟，更便于冲洗、易于监控。
生产车间的室内排水（包括楼层）宜采用无盖板的明沟，且明沟要有一定的宽度（200～300mm）、深度（150 ～400mm）和坡度（大于1%），车间地坪的排水坡度宜为1.5～2%
对于手术室来讲，为了维持本身房间的洁净度，免受邻室的污染，须保持相对于邻室较高的空气压力，即相对于邻室维持一个正的静压差。而静压差的存在起到了在门、窗关闭的情况下，防止室外空气由缝隙进入洁净室。另外当门开启时，应有足够的气流向外流动，把人瞬时带进的污染空气降低到至低程度。根据《空气洁净技术措施》中的规定，两相邻房间应保持5Pa的压差，而对室外保持15Pa的压差。对100级手术室，塑料车间净化，按《洁净室施工验收规范》规定，其正压满足开门时，距门0.6米处洁净度不低的要求，即保证在开门瞬时开启时人所带进的气体不深入门口0.6米以外的地方。空气调节设计手册中规定，一般洁净室的工作区在离地0.8-1.5米处。垂直层流手术室流速为0.25-0.3m/s。
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