实验室设计基本原则：人员流向、物流、气流要畅通；清洁区、缓冲区、污染区要分离。
在规定的实验区域，应控制工作人员数量和运输人员数量。在控制实验室通路的同时，洁净室净化灯，还应设置一些预备区，如接受样品或标本，准许进入实验室人员和参观者的通道。通过工作人员、自动传输、风力系统或其他自动化系统运输样品或标本。还应充分考虑内部通信联络系统和警报器以便通知或报警（如灾害、火警、样本到达、或实验室其部分寻求帮助等）。还应考虑实验室空间的扩展需要，将实验室设计为可向外扩展或者可以移动性，以满足实验室未来发展的空间有拓展的需要。运输和电脑网络系统分别用于实验室内和实验室与单位各科之间样品或标本运输和信息交流。国家的法律法规（有国家标准和行业标准等）在很大程度上影响到实验室设计，洁净室净化工程技术，在整个实验室设计中应由建筑师提出有关法规的要求。
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