控制系统:是整个洁净实验室-生物安全实验室安全运行的神经中枢。由于洁净实验室-生物安全实验室的实验对象是危险性的微生物，出于严格控制污染的原则，它要求以少的维护人员，运用至优化的管理维护手段，实验室设备，来实时监控每一个实验室中设备所处的物理环境，实验室，保证实验室运行过程中始终处于相对负压环境，防止危险性微生物外泄。
检测方案:是洁净实验室-生物安全实验室长期安全运行的保证。由于洁净实验室-生物安全实验室的特殊性，除了进行严格的设计、施工、调试外，为确保其安全性，必须对其进行必要的工程检测和严格的验收，达到安全要求和使用要求后才可投入运行。另外，使用过程中的一些因素，如非专业的管理和使用，过滤器的更换等，都会对实验室的安全性产生影响，因此，使用中的定期检测与同样重要。
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在建筑布局上也存在着不合理性，主要表现为清污路线不分。手术后的污物和无菌手术的器械及医生从同一条走廊进出，这样很容易产生交叉污染。
各手术室空气净化系统在手术室墙面四角、净化机组、天花板、走廊、新风机、排风机都设有不同级别的过滤器，科学实验室，并对其进行定期清洁、维修和更换，严格保证室内空气的无菌；另外，层流手术室的卫生管理工作除了日常清洁工作和过去一样，不能有丝毫放松，还对室内的清洁工作有特殊的要求，室内墙角全部为弧形结构设计，找不到任何一个90°的墙角，实验室制取二氧化碳，使细菌无处藏身，避免了清除不尽的死角，并且室内无须使用物理或化学方法进行消毒，这样既节省劳动又防止外来污染的进入。 
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