洁净空调系统分为三大系统：有机械系统、风系统、空调水系统
洁净空调的机械系统：洁净空调设备的运行是一个机械式磨合的过程，势必存在损耗，机械部件之间的损耗就会在润滑油沉积下来磨损的杂质。长期的磨损和拉伸就会使润滑油润滑性下降，甚至导致压缩机的烧毁。运行超过三年的设备，必须定期进行维护保养，有利于延长设备的寿命和运行。
洁净空调的风冷散热系统运行一段时间后也会积尘，积尘后直接导致风量的减小，降低了室内空气与新风的交换，降低了室内空气的品质，而且散热不良，导致高压过高，压缩机过载运行。
项目地址位于中国南方地区，该方案从设计角度上来说没有问题，实际经过调试以后，使用下来也没有出现太大的问题。但是在一些细节上，需要考虑：
（1）混风段串风问题，当机组送风机停掉以后，在室内外温差的作用下，新风会以小气流流经回风管至室内洁净区。
（2） 冷却盘管设置在负压段在国内很常见，但是会造成凝水盘常态带水，易导致凝水盘滋生有害物质。
（3）冷却盘管后面配有挡水板，会造成挡水板常态带水，易导致挡水板滋生有害物质。
（4）电机置于冷却盘管后面，冷凝水易被吸引至电机本体上，易导致电机接线端子受潮短路。
（5）加湿器置于过滤器之前，易使过滤器受潮而导致发霉。
（6）夏季为了去除新风中的水分，连带回风一起处理至室内露温度以下，由于制药厂大部分房间的发热量并不高，露温度送风必然会导致房间温度过低。为了控制温度，在夏季需要热盘管加热送风至合适的温度，从而维持室内温度在设计条件下。这样就造成了冷热抵消，增大了能耗。
风速和风量测试仪器：
(1)风速测量仪的作用原理有：机械式、散热率式和动力测压式等。
a．机械式风速仪：如翼形风速仪，它是利用流动气体的原动压推动机械装置来显示其流速的仪表。
b．散热率式风速仪：是根据流体中受热物体的散热率与流体流速成正比关系制成，测定传感器的散热率，即能测到流体的流速。常用的散热率式风速仪有：热线风速仪和热球风速仪等。
(2)风量测量仪：在洁净室中总风量的测试常用风管法，各房间送回风量多用风口法进行测量，其原理为平均风速乘以断面面积。
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